研究所与企业、机构、高校等合作，共同打造创新合作中心，以数字经济下具体产业及应用场景为研究对象，形成一系列的创新主题，布局数字经济生态。研究所帮助企业及机构解决数字化升级转型中遇到的具体问题或课题，企业及机构提供研究经费及应用场景等研究资源，共同推动创新中心的成果转化。

目前，已成立的创新合作中心主题包括数字能源、数字健康、数字金融、人工智能应用等。